RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.52■□□□□ 0.88
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SRRT-218ENST00000620394 CD244Q9BZW8 370 aa20.52■□□□□ 0.88
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SRRT-218ENST00000620394 PPT2Q9UMR5 302 aa20.52■□□□□ 0.88
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SRRT-218ENST00000620394 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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SRRT-218ENST00000620394 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.48■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 C3P1Q6ZMU1 363 aa20.48■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.48■□□□□ 0.87
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SRRT-218ENST00000620394 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 CCDC25Q86WR0 208 aa20.48■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.48■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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SRRT-218ENST00000620394 CCDC77Q9BR77 488 aa20.47■□□□□ 0.87
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