RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591971.5

PDE4A-208, Transcript of phosphodiesterase 4A, human

TSL 5

Gene PDE4A, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4A-208	ENST00000591971	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	BCORP1	Q8N888	145 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	NR4A3	Q92570	626 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TRMO	Q9BU70	441 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ASB1	Q9Y576	335 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	DYTN	A2CJ06	578 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971		G3V2L1	256 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	UGDH	O60701	494 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	SUPT7L	O94864	414 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	BPGM	P07738	259 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	CREB1	P16220	341 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	GRK2	P25098	689 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	RGS1	Q08116	209 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	RUNX2	Q13950	521 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	NSDHL	Q15738	373 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	INA	Q16352	499 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	C4orf17	Q53FE4	359 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TTMP	Q5BVD1	217 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	BEST3	Q8N1M1	668 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TEX9	Q8N6V9	391 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	SNX31	Q8N9S9	440 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	UBE2E3	Q969T4	207 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	WDR34	Q96EX3	536 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	HES7	Q9BYE0	225 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	STMN3	Q9NZ72	180 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	EMCN	Q9ULC0	261 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	APC	P25054	2843 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	LRIT2	A6NDA9	550 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971		A8MUI8	341 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	PRAMEF2	O60811	474 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	OTC	P00480	354 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	SERPIND1	P05546	499 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	SBK3	P0C264	359 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	GSTM2	P28161	218 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	HNF4A	P41235	474 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	CASP2	P42575	452 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ETV4	P43268	484 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	SERPINB4	P48594	390 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	NAGLU	P54802	743 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	KCNK10	P57789	538 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	AP2B1	P63010	937 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	PMP22	Q01453	160 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	IRF8	Q02556	426 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF33B	Q06732	778 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TUBA3C	Q13748	450 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	GTF2H2	Q13888	395 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TBCC	Q15814	346 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	EXT1	Q16394	746 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	LIPJ	Q5W064	366 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ABHD13	Q7L211	337 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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