RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRKAA2	P54646	552 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARG2	P78540	354 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC13A2	Q13183	592 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLAMF1	Q13291	335 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	FRG2	Q64ET8	278 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC5A8	Q8N695	610 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM47B	Q8NA70	645 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	FRG2B	Q96QU4	278 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CSF3R	Q99062	836 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SERPINI1	Q99574	410 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SCN2A	Q99250	2005 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501		A8MUI8	341 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	GLRA3	O75311	464 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SEMA7A	O75326	666 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	WDPCP	O95876	746 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	UQCRH	P07919	91 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	NUDT17	P0C025	328 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	DCT	P40126	519 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLCO1A2	P46721	670 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCT5	P48643	541 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	NEK2	P51955	445 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	TAS2R50	P59544	299 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLC	Q05315	142 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF33B	Q06732	778 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	IFT88	Q13099	833 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	BIK	Q13323	160 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SERTAD2	Q14140	314 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	MEP1A	Q16819	746 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACER2	Q5QJU3	275 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF787	Q6DD87	383 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	EMB	Q6PCB8	327 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CYP4X1	Q8N118	509 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	RNF175	Q8N4F7	328 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	AMER2	Q8N7J2	671 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CAVIN3	Q969G5	261 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC126	Q96EE4	140 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	PHF11	Q9UIL8	331 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501		A0A0A6YYD5	115 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR5H15	A6NDH6	313 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SH3BGRL	O75368	114 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SUPT7L	O94864	414 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	MLYCD	O95822	493 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRT15	P19012	456 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRHR1	P34998	444 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	BSG	P35613	385 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDH13	P55290	713 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	NAA20	P61599	178 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	INA	Q16352	499 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC153	Q494R4	210 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	UNC50	Q53HI1	259 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR180	Q86V85	440 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	TANK	Q92844	425 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	C19orf60	Q96EN9	201 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	CNDP1	Q96KN2	507 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM237	Q96Q45	408 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF382	Q96SR6	550 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	NPAS2	Q99743	824 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	BRF2	Q9HAW0	419 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ABI3	Q9P2A4	366 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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