RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLRB1Q12918 225 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC13A2Q13183 592 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BTBD16Q32M84 506 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAGE2Q7Z2X7 111 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPR180Q86V85 440 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TM9SF4Q92544 642 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AGAP4Q96P64 663 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRMOQ9BU70 441 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAM29Q9UKF5 820 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCN2AQ99250 2005 aa20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ULK1O75385 1050 aa20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALDH3A1P30838 453 aa20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNFRSF17Q02223 184 aa20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 METTL4Q8N3J2 472 aa20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DOCK10Q96BY6 2186 aa20.8■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CTNSO60931 367 aa20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CELA2AP08217 269 aa20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TERF2Q15554 542 aa20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CRB2Q5IJ48 1285 aa20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TEX19Q8NA77 164 aa20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 M1APQ8TC57 530 aa20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNA7Q96RP8 456 aa20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HBEGFQ99075 208 aa20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TGFBR3LH3BV60 316 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMPRSS11DO60235 418 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CRCPO75575 148 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGAMP11215 1152 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP2R1BP30154 601 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ETV4P43268 484 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HTR6P50406 440 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC26A5P58743 744 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSMF1Q92530 271 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNDP1Q96KN2 507 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MECRQ9BV79 373 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MMP25Q9NPA2 562 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATG4BQ9Y4P1 393 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASB4Q9Y574 426 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIMM22Q9Y584 194 aa20.78■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGAP10A1A4S6 786 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SERTM1A2A2V5 107 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TM9SF1O15321 606 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPHS1O60500 1241 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UQCRHP07919 91 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOX11P35716 441 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STX4Q12846 297 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MFAP5Q13361 173 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SERTAD2Q14140 314 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM219BQ5XKK7 198 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGFL2Q6UWQ7 119 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HOMEZQ8IX15 550 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACPTQ9BZG2 426 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR41Q9HAD4 459 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTGFRNQ9P2B2 879 aa20.77■□□□□ 0.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.76■□□□□ 0.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SUV39H1O43463 412 aa20.76■□□□□ 0.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PROM1O43490 865 aa20.76■□□□□ 0.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GBAP04062 536 aa20.76■□□□□ 0.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLK1P06870 262 aa20.76■□□□□ 0.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NR2F6P10588 404 aa20.76■□□□□ 0.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms