RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558040.5

SNX1-203, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-203ENST00000558040 B2RBV5 119 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 AIM2O14862 343 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 DKK1O94907 266 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 MED26O95402 600 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 RNH1P13489 461 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 CEACAM1P13688 526 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 CD1EP15812 388 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 NUDT2P50583 147 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 RAB15P59190 212 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 OLR1P78380 273 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 HES3Q5TGS1 186 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 OR52E8Q6IFG1 317 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 SLCO6A1Q86UG4 719 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 DSELQ8IZU8 1212 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 PSME2Q9UL46 239 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 CCDC187A0A096LP49 1063 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 FBP2O00757 339 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 SLC30A4O14863 429 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 CHST10O43529 356 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 KRT16P08779 473 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 LAMP1P11279 417 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 SHC2P98077 582 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 TLR1Q15399 786 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 C18orf63Q68DL7 685 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 OR4F3Q6IEY1 312 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 MMP21Q8N119 569 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 FAM47BQ8NA70 645 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 DNAJB8Q8NHS0 232 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 NUDT8Q8WV74 236 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 ROPN1LQ96C74 230 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 ITCHQ96J02 903 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 NPAS2Q99743 824 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 C1orf21Q9H246 121 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 GIMAP4Q9NUV9 329 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 GID8Q9NWU2 228 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 SLC39A1Q9NY26 324 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
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SNX1-203ENST00000558040 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 TM4SF5O14894 197 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 PDPK1O15530 556 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 NPPAP01160 153 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 JMJD7P0C870 316 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 CCL4P13236 92 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 PTPN4P29074 926 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 PPP2R1BP30154 601 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 NTSP30990 170 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 NFYCQ13952 458 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 DSG2Q14126 1118 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 ZNF385BQ569K4 471 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 C16orf89Q6UX73 402 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 CEACAM20Q6UY09 585 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 HACD2Q6Y1H2 254 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 DPP10Q8N608 796 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 TANKQ92844 425 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 COL26A1Q96A83 441 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 ZPBPQ9BS86 351 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 APMAPQ9HDC9 416 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 ENTPD4Q9Y227 616 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 ASPDHA6ND91 283 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 GLOD5A6NK44 160 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 CYR61O00622 381 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 GYG2O15488 501 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 KCNH1O95259 989 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 IL10P22301 178 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SNX1-203ENST00000558040 NCALDP61601 193 aa15.91■□□□□ 0.14
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