RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554207.1

PSMA3-205, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-205	ENST00000554207	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	S1PR3	Q99500	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CHEK1	O14757	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	AMBP	P02760	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	KRT6B	P04259	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	GNS	P15586	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ITGA3	P26006	1051 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	IFNAR2	P48551	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	KRT6C	P48668	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	SGCG	Q13326	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	SNX1	Q13596	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	PDIA5	Q14554	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	THRSP	Q92748	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	TXN2	Q99757	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ACTR8	Q9H981	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ANGPT2	O15123	496 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ECE2	O60344	883 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CAVIN2	O95810	425 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CFC1	P0CG37	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CYP2F1	P24903	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	NUMB	P49757	651 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ARFIP1	P53367	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	OVGP1	Q12889	678 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ZNF74	Q16587	644 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	DUSP5	Q16690	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	NACA2	Q9H009	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA3-205	ENST00000554207	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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