RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527118.5

RBBP4-218, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-218ENST00000527118 UBE2E3Q969T4 207 aa14.54□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 CCDC77Q9BR77 488 aa14.54□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.54□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.54□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.54□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 LYRM4Q9HD34 91 aa14.54□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.54□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.54□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ASNA1O43681 348 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 KLHL2O95198 593 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF24P17028 368 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 TYK2P29597 1187 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 PHBP35232 272 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 RFC3P40938 356 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 SSR2P43308 183 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 MEOX1P50221 254 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 CASP6P55212 293 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 STX4Q12846 297 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 SETDB1Q15047 1291 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.084e-9■□□□□ 8.8
RBBP4-218ENST00000527118 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 CHSY3Q70JA7 882 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 SULF2Q8IWU5 870 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 VPS11Q9H270 941 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RBBP4-218ENST00000527118 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 C17orf105B2RV13 164 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 OR2J2O76002 312 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 ZFAND5O76080 213 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 ACSL3O95573 720 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 TNNI3P19429 210 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 CPN2P22792 545 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 SERPINB1P30740 379 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 SERPINB8P50452 374 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 SSR4P51571 173 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 GPR85P60893 370 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 PCDH1Q08174 1060 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 ACAP2Q15057 778 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 KLC3Q6P597 504 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 MDGA2Q7Z553 956 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 IFT81Q8WYA0 676 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 GPR78Q96P69 363 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 ACTR8Q9H981 624 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 SPACA6W5XKT8 324 aa14.52□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 NOTCH2Q04721 2471 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 WWP2O00308 870 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 KLK8O60259 260 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 SCELO95171 688 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 ABOP16442 354 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 PTGER1P34995 402 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 RAP1GDS1P52306 607 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 SLAMF1Q13291 335 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 GTF2H2Q13888 395 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 SERTAD2Q14140 314 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RBBP4-218ENST00000527118 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms