RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515782.1

AP001961.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AP001961.1, Length 526 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP001961.1-201ENST00000515782 MMP12P39900 470 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 DAPP51397 102 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 EPHA5P54756 1037 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ITGA1P56199 1179 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 RAB4BP61018 213 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ERVK-8P63133 956 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ZNF33AQ06730 810 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 NPRL3Q12980 569 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 RPA4Q13156 261 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ITPK1Q13572 414 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 SSPNQ14714 243 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 KCNAB1Q14722 419 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 VEPH1Q14D04 833 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 EMC2Q15006 297 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 PGM5Q15124 567 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 UNC50Q53HI1 259 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 RABL3Q5HYI8 236 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 PAGE3Q5JUK9 113 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 PCID2Q5JVF3 399 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 MEDAGQ5VYS4 303 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 OR2T5Q6IEZ7 315 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 FUT10Q6P4F1 479 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 FAHD1Q6P587 224 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ERICH5Q6P6B1 374 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 PAMR1Q6UXH9 720 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 AHSA2Q719I0 299 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 BRINP3Q76B58 766 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 SHFQ7M4L6 423 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 CYP4Z1Q86W10 505 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 SKA3Q8IX90 412 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 MS4A15Q8N5U1 240 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 C12orf29Q8N999 325 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 C7orf57Q8NEG2 295 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 OR2T12Q8NG77 320 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 OR4A15Q8NGL6 344 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 OR2T29Q8NH02 315 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 HEXDCQ8WVB3 486 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 TWIST2Q8WVJ9 160 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 APH1BQ8WW43 257 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 TFAP2BQ92481 460 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 RIT1Q92963 219 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 TCEAL3Q969E4 200 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 SLC25A46Q96AG3 418 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 SCMH1Q96GD3 660 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 LINC00052Q96N35 136 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 SLC38A2Q96QD8 506 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 TMEM43Q9BTV4 400 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 BEX2Q9BXY8 128 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 GPR63Q9BZJ6 419 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ACTR6Q9GZN1 396 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 SIK2Q9H0K1 926 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 KCNH6Q9H252 994 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 ACSS2Q9NR19 701 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 COQ3Q9NZJ6 369 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 MPP6Q9NZW5 540 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 CLEC1BQ9P126 229 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 MLXQ9UH92 298 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001961.1-201ENST00000515782 SPATA2Q9UM82 520 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 698.7 ms