RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515459.5

LMNA-223, Transcript of lamin A/C, human

TSL 5

Gene LMNA, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMNA-223	ENST00000515459	FOXO1	Q12778	655 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	OPN5	Q6U736	354 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	GALNT7	Q86SF2	657 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CDC20B	Q86Y33	519 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SPC24	Q8NBT2	197 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	OR8K3	Q8NH51	312 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	VWA7	Q9Y334	891 aa		14.57	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459		A6NNC1	897 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SYT5	O00445	386 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CTNS	O60931	367 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CCL3	P10147	92 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	GNAZ	P19086	355 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	GSTM2	P28161	218 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	PLA2G16	P53816	162 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	STX4	Q12846	297 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	RCN2	Q14257	317 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	14.56	□□□□□ -0.08	6e-7	■■■■■ 36
LMNA-223	ENST00000515459	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	TRIM58	Q8NG06	486 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	OR2L5	Q8NG80	312 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SLCO2A1	Q92959	643 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	MBD6	Q96DN6	1003 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	LRRC46	Q96FV0	321 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	QRFPR	Q96P65	431 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SERINC2	Q96SA4	455 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CSF3R	Q99062	836 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	EGFL8	Q99944	293 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	DAPP1	Q9UN19	280 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		14.56	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	HSPB2	A8KAH6	182 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CYR61	O00622	381 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CLEC3A	O75596	197 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	TNNI3	P19429	210 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	HNMT	P50135	292 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	MTTP	P55157	894 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	LIM2	P55344	173 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	HSPB2	Q16082	182 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	FAM222B	Q8WU58	562 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CERS2	Q96G23	380 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	NAT9	Q9BTE0	207 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	NCKAP5	O14513	1909 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	C17orf105	B2RV13	164 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	DVL2	O14641	736 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	WDR47	O94967	919 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CERS1	P27544	350 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CDC25B	P30305	580 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	ASCL1	P50553	236 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CDKL1	Q00532	357 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	SERTAD2	Q14140	314 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	CYP1B1	Q16678	543 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	BIVM	Q86UB2	503 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	KRT78	Q8N1N4	520 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		14.54	□□□□□ -0.08
LMNA-223	ENST00000515459	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08

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