RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512343.5

RASGEF1B-209, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-209ENST00000512343 SH3BGRLO75368 114 aa20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 OR4D1Q15615 310 aa20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 UBE3DQ7Z6J8 389 aa20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 OR5M3Q8NGP4 307 aa20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SCYL1Q96KG9 808 aa20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 DERL2Q9GZP9 239 aa20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 GPRC5BQ9NZH0 403 aa20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 NCKAP5O14513 1909 aa20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 FANCGO15287 622 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CCDC166P0CW27 439 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 TNNI3P19429 210 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SLC12A2P55011 1212 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 STX4Q12846 297 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 GXYLT1Q4G148 440 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 GPSM1Q86YR5 675 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CREG2Q8IUH2 290 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 EXT2Q93063 718 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 C17orf105B2RV13 164 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 E7ESA3 106 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ACOT7O00154 380 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZSCAN12O43309 604 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CELA3AP09093 270 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 EPORP19235 508 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 GSTM2P28161 218 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SSTR1P30872 391 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 GGT5P36269 586 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 MAGEA5P43359 124 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 DNASE1L1P49184 302 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZNF585AQ6P3V2 769 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 MORN4Q8NDC4 146 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SLC2A12Q8TD20 617 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SMC6Q96SB8 1091 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 EHD1Q9H4M9 534 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 KCNJ16Q9NPI9 418 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SNX24Q9Y343 169 aa20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 STK16O75716 305 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 GLSO94925 669 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ETHE1O95571 254 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CD1DP15813 335 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CNR1P21554 472 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 MSX1P28360 303 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 RNF4P78317 190 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 POU4F1Q01851 419 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 PDK4Q16654 411 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 PAOXQ6QHF9 649 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 RTL4Q6ZR62 310 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 OR4N5Q8IXE1 308 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 TMEM251Q8N6I4 163 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 OR14A16Q8NHC5 309 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 DOK4Q8TEW6 326 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 NRGNQ92686 78 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CD274Q9NZQ7 290 aa20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CCL3P10147 92 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 MSH2P43246 934 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 KCNC1P48547 511 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CHIT1Q13231 466 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SPNS3Q6ZMD2 512 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 GK5Q6ZS86 529 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 WDR34Q96EX3 536 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 FAM173AQ9BQD7 235 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 FAM215AQ9Y5M1 114 aa20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms