RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 HAS2Q92819 552 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V1E2Q96A05 226 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TAAR6Q96RI8 345 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 NTMT1Q9BV86 223 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF32Q9H0A6 362 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP17.48■□□□□ 0.398e-7■■■□□ 19.2
SH3BP2-218ENST00000511185 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 GABRR3A8MPY1 467 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 FGF17O60258 216 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF224P0DH78 156 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 HSD17B3P37058 310 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBA3CQ13748 450 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 AP5B1Q2VPB7 878 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 GGTA1PQ4G0N0 100 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC50Q53HI1 259 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 C18orf63Q68DL7 685 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4C11Q6IEV9 310 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBA3EQ6PEY2 450 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CHSY3Q70JA7 882 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMC2Q8NEN0 867 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 NCLNQ969V3 563 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 REPS1Q96D71 796 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 HBEGFQ99075 208 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ROGDIQ9GZN7 287 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 STMN3Q9NZ72 180 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CROCCQ5TZA2 2017 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0A6YYD5 115 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV17A0A0B4J275 112 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 GBAP04062 536 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CPN2P22792 545 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 BSGP35613 385 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 HERVK_113P63132 956 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFRSF17Q02223 184 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SLAMF1Q13291 335 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF678Q5SXM1 525 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SH2D5Q6ZV89 423 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4N5Q8IXE1 308 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF321PQ8N8H1 164 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 MDS2Q8NDY4 140 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GNT7Q8NFL0 401 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPC4APQ8TEL6 797 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 UCN3Q969E3 161 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 RGMAQ96B86 450 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF354BQ96LW1 612 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVK-6Q9BXR3 956 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC29A3Q9BZD2 475 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CDCP1Q9H5V8 836 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAP2Q9NPF8 381 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRE2Q9UHX3 823 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TEKT2Q9UIF3 430 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ATG4BQ9Y4P1 393 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP10A1A4S6 786 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN4O14493 209 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4F21O95013 312 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR143P51810 404 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R50P59544 299 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PHEXP78562 749 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CLCQ05315 142 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 MEP1AQ16819 746 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SGO1Q5FBB7 561 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FRG2Q64ET8 278 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC5A8Q8N695 610 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ACMSDQ8TDX5 336 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FRG2BQ96QU4 278 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PS29 197 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 WASHC1A8K0Z3 465 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF2O60811 474 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CTNSO60931 367 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMA7AO75326 666 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SUPT7LO94864 414 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CBX6O95503 412 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 AIFM1O95831 613 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CD96P40200 585 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CUL3Q13618 768 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 TERF2Q15554 542 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1C1Q15619 314 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM180AQ6UWF9 173 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 MILR1Q7Z6M3 343 aa17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms