RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SIAEQ9HAT2 523 aa6.3□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.3□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.3□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AGAP14A8MT82 685 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSPAN6O43657 245 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AIREO43918 545 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SSX4O60224 188 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RFPL2O75678 378 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNAJB5O75953 348 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCGB1D2O95969 90 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C9P02748 559 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HSMCR30P0CW71 290 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ETFAP13804 333 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HIST1H2ADP20671 130 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRPS1L1P21108 318 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LTBRP36941 435 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR85P60893 370 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CXCR4P61073 352 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MC1RQ01726 317 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTAPQ13126 283 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTA1Q13330 715 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NAE1Q13564 534 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DOC2AQ14183 400 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF385BQ569K4 471 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC38A4Q969I6 547 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 Q96MT0 163 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR4K3Q96R72 315 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CENPOQ9BU64 300 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR27Q9NS67 375 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RHCGQ9UBD6 479 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM170BA6NMN3 283 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TNFRSF11BO00300 401 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRRG1O14668 218 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SGTAO43765 313 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTHP01270 115 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GSTM1P09488 218 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SRCP12931 536 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HLA-EP13747 358 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BMP8BP34820 402 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CRATP43155 626 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP3CCP48454 512 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SERPINB10P48595 397 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRPC1P48995 793 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP5CP53041 499 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCL23P55773 120 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITGA1P56199 1179 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMARCB1Q12824 385 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TIGD6Q17RP2 521 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR33Q49SQ1 333 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RETSATQ6NUM9 610 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 P3H2Q8IVL5 708 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MMP21Q8N119 569 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POC5Q8NA72 575 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCRN2Q96FV2 425 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TOX2Q96NM4 488 aa6.29□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DUSP26Q9BV47 211 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms