RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 CD69Q07108 199 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ITGADQ13349 1161 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MADCAM1Q13477 382 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MED21Q13503 144 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.89□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 E7EWF7 191 aa6.88□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 CHUKO15111 745 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF205O95201 554 aa6.88□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 ACTBL2Q562R1 376 aa6.88□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 TXNDC8Q6A555 127 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PGAP1Q75T13 922 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 HORMAD1Q86X24 394 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.88□□□□□ -1.31
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