RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 AGTRAPQ6RW13 159 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SCIMPQ6UWF3 145 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 LCTLQ6UWM7 567 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SCUBE1Q8IWY4 988 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 RASGEF1CQ8N431 466 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CCDC89Q8N998 374 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 MORN4Q8NDC4 146 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 FAM13CQ8NE31 585 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TRPV3Q8NET8 790 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 OR8K3Q8NH51 312 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 NT5CQ8TCD5 201 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TMEM171Q8WVE6 324 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 UCN3Q969E3 161 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ZNF597Q96LX8 424 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ZFP3Q96NJ6 502 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CHP1Q99653 195 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 DOHHQ9BU89 302 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 IL22Q9GZX6 179 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TREX1Q9NSU2 369 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 BFARQ9NZS9 450 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ZFP69BQ9UJL9 534 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.56e-8■■■■■ 28
CBX1-205ENST00000495350 DSCAMO60469 2012 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CTAGE9A4FU28 777 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 B3GALT2O43825 422 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 C8GP07360 202 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CYP4B1P13584 511 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 COX7A2P14406 83 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 NMBRP28336 390 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 RPL22P35268 128 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 MAGEA1P43355 309 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 MASP1P48740 699 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 RGS4P49798 205 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CLCN7P51798 805 aa5.65□□□□□ -1.5
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CBX1-205ENST00000495350 RNF4P78317 190 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 BTN3A2P78410 334 aa5.65□□□□□ -1.5
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CBX1-205ENST00000495350 TNK1Q13470 666 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CSHL1Q14406 222 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.57e-7■■■■■ 27.5
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CBX1-205ENST00000495350 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 AADACL2Q6P093 401 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 HIPK1Q86Z02 1210 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 VSTM4Q8IW00 320 aa5.65□□□□□ -1.5
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CBX1-205ENST00000495350 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CA13Q8N1Q1 262 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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CBX1-205ENST00000495350 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CCT6BQ92526 530 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 KCNJ9Q92806 393 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 FAM111AQ96PZ2 611 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TIMP4Q99727 224 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TM9SF2Q99805 663 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 AIF1LQ9BQI0 150 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TRIM5Q9C035 493 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PIGMQ9H3S5 423 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CALHM2Q9HA72 323 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PARVBQ9HBI1 364 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.65□□□□□ -1.5
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