RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-215	ENST00000494945	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	STARD5	Q9NSY2	213 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ADA2	Q9NZK5	511 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PTPRB	P23467	1997 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	NIN	Q8N4C6	2090 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945		H3BMH7	237 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PDPK1	O15530	556 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	DNAJA2	O60884	412 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CIB2	O75838	187 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ANP32D	O95626	131 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	AIFM1	O95831	613 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CTSB	P07858	339 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	IL1RN	P18510	177 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CPN2	P22792	545 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ME2	P23368	584 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PTPN6	P29350	595 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	AVPR1B	P47901	424 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	SLC7A2	P52569	658 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ITGA1	P56199	1179 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ACY1	Q03154	408 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	RUNX2	Q13950	521 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	SPIDR	Q14159	915 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	KCNAB1	Q14722	419 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	GPR19	Q15760	415 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PDSS2	Q86YH6	399 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	GPR135	Q8IZ08	494 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CA13	Q8N1Q1	262 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	MIEF2	Q96C03	454 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	MVB12A	Q96EY5	273 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	GBP5	Q96PP8	586 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PHF12	Q96QT6	1004 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CDC6	Q99741	560 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	INPP5K	Q9BT40	448 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	NANOG	Q9H9S0	305 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	FGF21	Q9NSA1	209 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	VAPA	Q9P0L0	249 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PSME2	Q9UL46	239 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	DMD	P11532	3685 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945		A0A1W2PRB8	838 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	BLACE	A4D250	179 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945		H0YIG0	161 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	NME4	O00746	187 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CBFA2T3	O75081	653 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	HSD17B1	P14061	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	FOLR1	P15328	257 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	NTS	P30990	170 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CDKN2C	P42773	168 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	GCGR	P47871	477 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ARSF	P54793	590 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	RAB38	P57729	211 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PLIN5	Q00G26	463 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	ILK	Q13418	452 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	MLC1	Q15049	377 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	MPEG1	Q2M385	716 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	C18orf63	Q68DL7	685 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-215	ENST00000494945	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74

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