RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485645.5

SMC4-216, Transcript of structural maintenance of chromosomes 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMC4, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4-216ENST00000485645 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 C19orf84I3L1E1 186 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ADAM10O14672 748 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 RAD51CO43502 376 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 OR2J2O76002 312 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 TUBB4AP04350 444 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 TPOP07202 933 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 EPORP19235 508 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 MSH2P43246 934 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 GPX6P59796 221 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 IL20RBQ6UXL0 311 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 HSDL2Q6YN16 418 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 RAPH1Q70E73 1250 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CD163Q86VB7 1156 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 MORN4Q8NDC4 146 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 PSD4Q8NDX1 1056 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ASB15Q8WXK1 588 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 UBE2E3Q969T4 207 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 TRIM8Q9BZR9 551 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ALG9Q9H6U8 611 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 LYRM4Q9HD34 91 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 GRHL1Q9NZI5 618 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 MYOTQ9UBF9 498 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SPACA6W5XKT8 324 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 FBN2P35556 2912 aa15.94■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 C1QAP02745 245 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 TNNI3P19429 210 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CASQ1P31415 396 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CASP2P42575 452 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SERTAD2Q14140 314 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 PPM1NQ8N819 430 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 OR52N2Q8NGI0 321 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SDCCAG3Q96C92 435 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 LURAP1Q96LR2 239 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 MS4A8Q9BY19 250 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 NMRAL1Q9HBL8 299 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SUPT3HB4E1H0 165 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 WWP2O00308 870 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 LDB3O75112 727 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SUPT3HO75486 399 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 FAM155BO75949 473 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 PDE9AO76083 593 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 OR6B1O95007 311 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 PCNAP12004 261 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 GMPRP36959 345 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SOX3P41225 446 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 KIR3DL1P43629 444 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 PLTPP55058 493 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CAV1Q03135 178 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 C2orf54Q08AI8 447 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 E2F2Q14209 437 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SLMAPQ14BN4 828 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 MED27Q6P2C8 311 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 PAOXQ6QHF9 649 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SYT10Q6XYQ8 523 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ZNF793Q6ZN11 406 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CHSY3Q70JA7 882 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CMC1Q7Z7K0 106 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ISCA2Q86U28 154 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CCDC25Q86WR0 208 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 LAS2Q8IYD9 372 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 RASL10BQ96S79 203 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 PHACTR1Q9C0D0 580 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 OR8D2Q9GZM6 311 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 DEPPQ9NTK1 212 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 OPTCQ9UBM4 332 aa15.92■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 C17orf105B2RV13 164 aa15.91■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 K7EPI3 171 aa15.91■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 ACOT7O00154 380 aa15.91■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SH3BGRLO75368 114 aa15.91■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 TGFB1P01137 390 aa15.91■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.91■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CPN2P22792 545 aa15.91■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 CRABP2P29373 138 aa15.91■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SERPINB1P30740 379 aa15.91■□□□□ 0.14
SMC4-216ENST00000485645 SSTR2P30874 369 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms