RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SCN2AQ99250 2005 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SYCE1LA8MT33 242 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 COPEO14579 308 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 FOXS1O43638 330 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 RDH16O75452 317 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SCTRP47872 440 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 KCNC1P48547 511 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 XKR6Q5GH73 641 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A25Q6KCM7 469 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 NIPAL1Q6NVV3 410 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CCDC91Q7Z6B0 441 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ISCA2Q86U28 154 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP10.94□□□□□ -0.665e-7■■■□□ 17.6
PRAME-210ENST00000442481 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 KRT78Q8N1N4 520 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD42Q8N9B4 389 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 OR4K1Q8NGD4 311 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 OR51Q1Q8NH59 317 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SDCCAG3Q96C92 435 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 APOPT1Q96IL0 206 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 FRMD6Q96NE9 622 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CAPS2Q9BXY5 557 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 OPTCQ9UBM4 332 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 EDARQ9UNE0 448 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ACTL7BQ9Y614 415 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SPG11Q96JI7 2443 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 GABRR3A8MPY1 467 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 GLRA3O75311 464 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 KLHL2O95198 593 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 B3GALT4O96024 378 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SP1P08047 785 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CD96P40200 585 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 KIR3DL1P43629 444 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 XCR1P46094 333 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 RAB8AP61006 207 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 PPP2R2AP63151 447 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 OLR1P78380 273 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 IRF8Q02556 426 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SLC18A2Q05940 514 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ACAP2Q15057 778 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 PFKFB4Q16877 469 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 DEFB134Q4QY38 66 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SH2D5Q6ZV89 423 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ABHD13Q7L211 337 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CRLF3Q8IUI8 442 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 AMER2Q8N7J2 671 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 BANPQ8N9N5 519 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ACBD4Q8NC06 268 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 POM121Q96HA1 1249 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 OR1F2PQ96R84 312 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ATOH8Q96SQ7 321 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CD244Q9BZW8 370 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ZNF358Q9NW07 568 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 LRFN1Q9P244 771 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ASB1Q9Y576 335 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.92□□□□□ -0.664e-11■□□□□ 9.7
PRAME-210ENST00000442481 ABCA2Q9BZC7 2435 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 TMEM120BA0PK00 339 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 URADA6NGE7 173 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 FCHO1O14526 889 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 DIAPH2O60879 1101 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A12O75746 678 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 PCNAP12004 261 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 ALOX12P18054 663 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 JAK1P23458 1154 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 AHRP35869 848 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CYB561P49447 251 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 GTF3C1Q12789 2109 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CHIT1Q13231 466 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 PWP1Q13610 501 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 DOC2AQ14183 400 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 HERC3Q15034 1050 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 NSDHLQ15738 373 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 MAPKAPK3Q16644 382 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CDKL4Q5MAI5 379 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 CES4AQ5XG92 561 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-210ENST00000442481 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms