RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NPY6RQ99463 290 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB18Q99592 522 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TAPBPLQ9BX59 468 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GLOD4Q9HC38 313 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KCMF1Q9P0J7 381 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB23Q9ULC3 237 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0A6YYJ9 748 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX46H3BTG2 121 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS8O00214 317 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC7O00311 574 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR32O75388 356 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF1O95521 474 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 B3GALT4O96024 378 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 IFNA14P01570 189 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM157BP0CG42 384 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FDXRP22570 491 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PSEN2P49810 448 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC32Q14392 662 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRRQ15256 657 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL22Q53GT1 634 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 DDI2Q5TDH0 399 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD46Q86W74 232 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL6Q8TCB7 284 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 WNT8BQ93098 351 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ULK4Q96C45 1275 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52E6Q96RD3 313 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ACPTQ9BZG2 426 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GSX2Q9BZM3 304 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FBRSQ9HAH7 460 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SP110Q9HB58 689 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 INPPL1O15357 1258 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 DOK2O60496 412 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KERAO60938 352 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ASGR1P07306 291 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MAOBP27338 520 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NNMTP40261 264 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MLIPQ5VWP3 458 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LIX1Q8N485 282 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC5A11Q8WWX8 675 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM203Q969S6 136 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA33Q96N06 139 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FCRL5Q96RD9 977 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NPAS1Q99742 590 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LDAHQ9H6V9 325 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PCTPQ9UKL6 214 aa8.04□□□□□ -1.12
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