RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3B-206ENST00000436282 TAGAPQ8N103 731 aa14.25□□□□□ -0.13
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TOP3B-206ENST00000436282 PLA2G10O15496 165 aa14.25□□□□□ -0.13
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