RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PPW3 197 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PQF6 199 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPIND1P05546 499 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JUNDP17535 347 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX5P17844 614 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCMT1P22061 227 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLA2G16P53816 162 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CXCR4P61073 352 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS26P62854 115 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPB3Q12988 150 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP27C1Q4G0S4 372 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGD3Q5JSP0 725 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4C11Q6IEV9 310 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMER3Q8N944 861 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMYD1Q8NB12 490 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4C15Q8NGM1 316 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUL1Q969V5 352 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDXPQ96GD0 296 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AICDAQ9GZX7 198 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MVB12BQ9H7P6 319 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDM8Q9NQV8 689 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB23Q9ULC3 237 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0A6YYD5 115 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0G2JN53 185 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBC2A0A5B9 178 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRIT2A6NDA9 550 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPM1DO15297 605 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC31A1O15431 190 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF10O60809 474 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGA2P17301 1181 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITIH1P19827 911 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL9A1P20849 921 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH12P55289 794 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP2CBP62714 309 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP2CAP67775 309 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPP38P78345 283 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPIBQ01892 262 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REEP3Q6NUK4 255 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARMC8Q8IUR7 673 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM20CQ8IXL6 584 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HORMAD2Q8N7B1 307 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTLQ8NG68 377 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FEVQ99581 238 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C17orf62Q9BQA9 187 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC90BQ9GZT6 254 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGF22Q9HCT0 170 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCAMP1O15126 338 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXB2P14652 356 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPK10P53779 464 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35A2P78381 396 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB30Q15771 203 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52J3Q8NH60 311 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DGCR6LQ9BY27 220 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUSP21Q9H596 190 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBRSQ9HAH7 460 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC6A20Q9NP91 592 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPRKBQ9Y3C4 175 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJB5O75953 348 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCL6P41182 706 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSR2P43308 183 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAM15Q13444 863 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPE65Q16518 533 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC5A8Q8N695 610 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10G2Q8NGC3 310 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB2BQ8WUD1 216 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC38A5Q8WUX1 472 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HRASLS5Q96KN8 279 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PREBQ9HCU5 417 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A4GALTQ9NPC4 353 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3GLB1Q9Y371 365 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX11Q9Y5W9 270 aa17.78■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP290O15078 2479 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B4GALT2O60909 372 aa17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EGFP01133 1207 aa17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms