RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 LHFPL3Q86UP9 236 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM80Q96HE8 168 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MGLLQ99685 303 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SCDO00767 359 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA0513O60268 411 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 IFNA5P01569 189 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 IFNA4P05014 189 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KLK1P06870 262 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ELNP15502 786 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MAP2K3P46734 347 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJB13P59910 316 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.041e-6■■■□□ 17.3
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CGB2Q6NT52 195 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FAM129CQ86XR2 697 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC120Q96HB5 630 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ASB3Q9Y575 518 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CLCA1A8K7I4 914 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PTNP21246 168 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HOXD12P35452 270 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SOX9P48436 509 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PPP5CP53041 499 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ACTR1AP61163 376 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CD47Q08722 323 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GNMTQ14749 295 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MLC1Q15049 377 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SSX6Q7RTT6 188 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SMARCD2Q92925 531 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DGAT2Q96PD7 388 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LHPPQ9H008 270 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ITGB4P16144 1822 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM64BA6NI03 449 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FAM170BA6NMN3 283 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SCGB1D2O95969 90 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 APOC3P02656 99 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GKN3PP0CG01 181 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HOXC8P31273 242 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 WASP42768 502 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DHCR24Q15392 516 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CCL14Q16627 93 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 VITQ6UXI7 678 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ACDQ96AP0 544 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ITPKCQ96DU7 683 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF778Q96MU6 729 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR5B12Q96R08 314 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC29A3Q9BZD2 475 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KRBA1A5PL33 1030 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 H3BMQ9 156 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 H7C417 338 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC1A7O00341 560 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SOX30O94993 753 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SPARCP09486 303 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DNASE1P24855 282 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BMP8BP34820 402 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KCNJ5P48544 419 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PGDP52209 483 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 STC1P52823 247 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CHRNA6Q15825 494 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM156Q8N614 296 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RTP4Q96DX8 246 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 COG8Q96MW5 612 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DERL2Q9GZP9 239 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms