RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A1W2PNN7 141 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FEZF1A0PJY2 475 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF724A8MTY0 619 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A8MVM7 634 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TCP10L2B9ZVM9 353 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LMO7DNF2Z398 122 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 I3L1I5 382 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PES1O00541 588 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AP3D1O14617 1153 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPAG7O75391 227 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BBOX1O75936 387 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TIMP1P01033 207 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 INSP01308 110 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CISD3P0C7P0 127 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IRF2P14316 349 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MMP9P14780 707 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDGFRAP16234 1089 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NPY1RP25929 384 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HTR1EP28566 365 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CD1BP29016 333 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GDI1P31150 447 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OTX2P32243 289 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CETN2P41208 172 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NRIP1P48552 1158 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CSNK1DP48730 415 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HARS2P49590 506 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RARSP54136 660 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TIMM10P62072 90 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OLR1P78380 273 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RBBP4Q09028 425 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRT33BQ14525 404 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC38Q502W7 563 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CFAP77Q6ZQR2 320 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 Q6ZR03 302 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 Q71RC1 249 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AACSQ86V21 672 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SCYL3Q8IZE3 742 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR4C15Q8NGM1 316 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HTRA1Q92743 480 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMARCE1Q969G3 411 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRIM63Q969Q1 353 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MOAP1Q96BY2 351 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ELMOD3Q96FG2 381 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNF185Q96GF1 192 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GPATCH3Q96I76 525 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 APOPT1Q96IL0 206 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM210BQ96KR6 192 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBXN10Q96LJ8 280 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM173AQ9BQD7 235 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NRIP2Q9BQI9 281 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TTYH2Q9BSA4 534 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NICN1Q9BSH3 213 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 Q9H3A6 140 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NMUR1Q9HB89 426 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBN1Q9NPG3 1134 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PIGVQ9NUD9 493 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DUSP12Q9UNI6 340 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACEP12821 1306 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADGRL1O94910 1474 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CACNA1GO43497 2377 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A1W2PR77 199 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MACROD2A1Z1Q3 448 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C7orf66A4D0T2 115 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NPIPB7O75200 414 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MBD4O95243 580 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CTDNEP1O95476 244 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ANGPTL1O95841 491 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC25A27O95847 323 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CD4P01730 458 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGHV2-70P01814 119 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ANGP03950 147 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC159P0C7I6 412 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HSD17B1P14061 328 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMEM11P17152 192 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ICAM3P32942 547 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TGFBR1P36897 503 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DLSTP36957 453 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EVCP57679 992 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GSTO1P78417 241 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VLDLRP98155 873 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BAMBIQ13145 260 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 COX19Q49B96 90 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms