RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 HHIPL1Q96JK4 782 aa13.21□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 RHOVQ96L33 236 aa13.21□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 KLHL5Q96PQ7 755 aa13.21□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 RNF32Q9H0A6 362 aa13.21□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 PCDH9Q9HC56 1237 aa13.21□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
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CTIF-202ENST00000382998 CNTN3Q9P232 1028 aa13.21□□□□□ -0.3
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CTIF-202ENST00000382998 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa13.2□□□□□ -0.3
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CTIF-202ENST00000382998 C14orf28Q4W4Y0 310 aa13.2□□□□□ -0.3
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CTIF-202ENST00000382998 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.2□□□□□ -0.3
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CTIF-202ENST00000382998 TVP23AA6NH52 213 aa13.2□□□□□ -0.3
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CTIF-202ENST00000382998 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 SLC2A9Q9NRM0 540 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 IRAK3Q9Y616 596 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ZNF487B1APH4 448 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 CDK14O94921 469 aa13.2□□□□□ -0.3
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CTIF-202ENST00000382998 ASPNQ9BXN1 380 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 SUV39H2Q9H5I1 410 aa13.2□□□□□ -0.3
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CTIF-202ENST00000382998 ELOVL1Q9BW60 279 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 A0A1B0GVI7 797 aa13.19□□□□□ -0.3
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