RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa23.24■■□□□ 1.31
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ECHDC3-201ENST00000379215 MUC13Q9H3R2 512 aa23.24■■□□□ 1.31
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ECHDC3-201ENST00000379215 A8MU76 341 aa23.22■■□□□ 1.31
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ECHDC3-201ENST00000379215 MSRB3Q8IXL7 192 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHDC3-201ENST00000379215 TNIP2Q8NFZ5 429 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHDC3-201ENST00000379215 C10orf90Q96M02 699 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHDC3-201ENST00000379215 ECSITQ9BQ95 431 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHDC3-201ENST00000379215 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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ECHDC3-201ENST00000379215 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHDC3-201ENST00000379215 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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ECHDC3-201ENST00000379215 RIPK1Q13546 671 aa23.21■■□□□ 1.31
ECHDC3-201ENST00000379215 RUNX2Q13950 521 aa23.21■■□□□ 1.31
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ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa23.21■■□□□ 1.31
ECHDC3-201ENST00000379215 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa23.2■■□□□ 1.3
ECHDC3-201ENST00000379215 D6RAR5 112 aa23.2■■□□□ 1.3
ECHDC3-201ENST00000379215 H0YIG0 161 aa23.2■■□□□ 1.3
ECHDC3-201ENST00000379215 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ECHDC3-201ENST00000379215 MGRN1O60291 552 aa23.2■■□□□ 1.3
ECHDC3-201ENST00000379215 C6orf47O95873 294 aa23.2■■□□□ 1.3
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