RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363849.1

RNA5SP260-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 260, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP260, Length 111 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP260-201ENST00000363849 TCP10LQ8TDR4 215 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SELENOMQ8WWX9 145 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 AGAP4Q96P64 663 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SMC6Q96SB8 1091 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 LPAR4Q99677 370 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 PRM3Q9NNZ6 103 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 MMP25Q9NPA2 562 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 FBXW2Q9UKT8 454 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SNX6Q9UNH7 406 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SPACA6W5XKT8 324 aa7□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SERTM1A2A2V5 107 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 MANBAO00462 879 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 CLDN4O14493 209 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 TMPRSS11DO60235 418 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 CTNSO60931 367 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SPAG7O75391 227 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ERLIN1O75477 346 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 KRT6AP02538 564 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 KRT6BP04259 564 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ITGAMP11215 1152 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 CPN2P22792 545 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 HMOX2P30519 316 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 CASRP41180 1078 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 KRT6CP48668 564 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 CD97P48960 835 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 HTR6P50406 440 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 TNFRSF17Q02223 184 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SLC13A2Q13183 592 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 MFAP5Q13361 173 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 BTBD16Q32M84 506 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 NADK2Q4G0N4 442 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 CROCCP2Q86T23 111 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ZNF605Q86T29 641 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 GPR180Q86V85 440 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 METTL4Q8N3J2 472 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 Q8NA96 180 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 METTL6Q8TCB7 284 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ELP5Q8TE02 316 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 TM9SF4Q92544 642 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 KCNA7Q96RP8 456 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 LMF1Q96S06 567 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 EPN3Q9H201 632 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 AHSPQ9NZD4 102 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 PHF11Q9UIL8 331 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ASB4Q9Y574 426 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 NBASA2RRP1 2371 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.99□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 A0A1W2PR48 441 aa6.98□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 PROM1O43490 865 aa6.98□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 SLC28A2O43868 658 aa6.98□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 FGF17O60258 216 aa6.98□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 TRIM13O60858 407 aa6.98□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 LDB3O75112 727 aa6.98□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 ULK1O75385 1050 aa6.98□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.98□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 PLA2G2AP14555 144 aa6.98□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RNA5SP260-201ENST00000363849 PPP2R1BP30154 601 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms