RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 ZXDBP98169 803 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 OPCMLQ14982 345 aa15.96■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 OR8J1Q8NGP2 316 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 XAGE5Q8WWM1 108 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CDCP1Q9H5V8 836 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SGK2Q9HBY8 427 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 NDUFAF4Q9P032 175 aa15.96■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 IRAK3Q9Y616 596 aa15.96■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 ARHGDIBP52566 201 aa15.96■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CDH4P55283 916 aa15.96■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ARMC12Q5T9G4 340 aa15.96■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 Q6ZSR9 355 aa15.96■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR5J2Q8NH18 312 aa15.96■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 M0R082 166 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 KIAA1024LP59773 190 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 GINS1Q14691 196 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TEX261Q6UWH6 196 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR10H4Q8NGA5 316 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SRRQ9GZT4 340 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SPATC1LQ9H0A9 340 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SPNS1Q9H2V7 528 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CACNG2Q9Y698 323 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 U3KQ87 197 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 H1F0P07305 194 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZNF33AQ06730 810 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SHFQ7M4L6 423 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TTC9Q92623 222 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR10A4Q9H209 315 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 BCORQ6W2J9 1755 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 USP2O75604 605 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-201ENST00000320580 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TSPAN33Q86UF1 283 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 LRR1Q96L50 414 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 RAI2Q9Y5P3 530 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ACTL7AQ9Y615 435 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 MAFKO60675 156 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 GPR85P60893 370 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 MC2RQ01718 297 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZNF234Q14588 700 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 AAK1Q2M2I8 961 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PYHIN1Q6K0P9 492 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 RGMBQ6NW40 437 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZNF730Q6ZMV8 503 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CLDN19Q8N6F1 224 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 LHFPL5Q8TAF8 219 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 COPS3Q9UNS2 423 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 GLTPD2A6NH11 291 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZNF879B4DU55 563 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TAS2R41P59536 307 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CARNMT1Q8N4J0 409 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 KIAA1958Q8N8K9 716 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR6M1Q8NGM8 313 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR52P1PQ8NH57 321 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.143e-6■■■□□ 15.4
PACS1-201ENST00000320580 SLITRK2Q9H156 845 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 NAV1Q8NEY1 1877 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 LRRN3E7EW58 273 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CDH11P55287 796 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CTBP2P56545 445 aa15.94■□□□□ 0.14
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