RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 ERGP11308 486 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 NPPBP16860 134 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 DGKQP52824 942 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 POLE2P56282 527 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 CLDN8P56748 225 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 BNIP2Q12982 314 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 TAF11Q15544 211 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 MUM1Q2TAK8 710 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 APIPQ96GX9 242 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 FCRL4Q96PJ5 515 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 EFHD1Q9BUP0 239 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 EHD1Q9H4M9 534 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 SLAMF8Q9P0V8 285 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 HCRTR1O43613 425 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 IL6P05231 212 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 SDC1P18827 310 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 TCN2P20062 427 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 PWP1Q13610 501 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ATG9BQ674R7 924 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 LCN10Q6JVE6 187 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM73Q86UV7 250 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 SPATA24Q86W54 205 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 KBTBD2Q8IY47 623 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 NUDT8Q8WV74 236 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 SLC13A3Q8WWT9 602 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 MUC13Q9H3R2 512 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 SCRG1O75711 98 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 RPN2P04844 631 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ACADSP16219 412 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ATP6V1C1P21283 382 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 DNASE1L3Q13609 305 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ERV3-1Q14264 604 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGAP19Q14CB8 494 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ZIC1Q15915 447 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 RABL3Q5HYI8 236 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 NANOGP8Q6NSW7 305 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 DHFR2Q86XF0 187 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 RNF175Q8N4F7 328 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 OR7G3Q8NG95 312 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 OR1L3Q8NH93 324 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 TESCQ96BS2 214 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 OR2A14Q96R47 310 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 MENTQ9BUN1 341 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 NANOGQ9H9S0 305 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 FAM60AQ9NP50 221 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 DYRK1BQ9Y463 629 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 DNAJA2O60884 412 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 PGRP06401 933 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 UGT2B7P16662 529 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 GSK3BP49841 420 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 RPS18P62269 152 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 FXNQ16595 210 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 LCN8Q6JVE9 175 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 NOXRED1Q6NXP6 359 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 SPESP1Q6UW49 350 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 TMPRSS11BQ86T26 416 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 LAS2Q8IYD9 372 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 GTF2H4Q92759 462 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 CGREF1Q99674 301 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 RIMS3Q9UJD0 308 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 SH2B3Q9UQQ2 575 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC6-201ENST00000243108 RELNP78509 3460 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms