RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LHPPQ9H008 270 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 WASHC1A8K0Z3 465 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PROM1O43490 865 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CTNSO60931 367 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ULK1O75385 1050 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 KRT6AP02538 564 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 GBAP04062 536 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 KRT6BP04259 564 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 BPGMP07738 259 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ITGAMP11215 1152 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 KRT6CP48668 564 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PGDP52209 483 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 OR4D2P58180 307 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CASP8Q14790 479 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CFAP157Q5JU67 520 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CES4AQ5XG92 561 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 C18orf63Q68DL7 685 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 GPR180Q86V85 440 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CHTF18Q8WVB6 975 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CNDP1Q96KN2 507 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CENPHQ9H3R5 247 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.89■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PR48 441 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 HSD3B1P14060 373 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 HSD3B2P26439 372 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB3P29508 390 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R1BP30154 601 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 HMOX2P30519 316 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SCIMPQ6UWF3 145 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 IGFL2Q6UWQ7 119 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ACPTQ9BZG2 426 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 C5AR2Q9P296 337 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ADAM29Q9UKF5 820 aa20.88■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 B8ZZF3 427 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CLDN4O14493 209 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 KLK1P06870 262 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CHRNGP07510 517 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CPN2P22792 545 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SOX11P35716 441 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CD97P48960 835 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ZNF33BQ06732 778 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 RCN2Q14257 317 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 NUDT13Q86X67 352 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 MS4A12Q9NXJ0 267 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.87■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 H3BQF6 201 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 NPHS1O60500 1241 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 LDB3O75112 727 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ICAM2P13598 275 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A5P58743 744 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 HMGCS1Q01581 520 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF17Q02223 184 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SLC13A2Q13183 592 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 H3F3CQ6NXT2 135 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CUZD1Q86UP6 607 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 M1APQ8TC57 530 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 TLCD1Q96CP7 247 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 LPAR4Q99677 370 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 TRMOQ9BU70 441 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 AHSPQ9NZD4 102 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PHF11Q9UIL8 331 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CCL27Q9Y4X3 112 aa20.86■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ZNF462Q96JM2 2506 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 A8MUA0 341 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 FGF17O60258 216 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms