RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 OR5K1Q8NHB7 308 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 CLHC1Q8NHS4 586 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 GPBAR1Q8TDU6 330 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 MOAP1Q96BY2 351 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 MIEF2Q96C03 454 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 TM4SF18Q96CE8 201 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PRAP1Q96NZ9 151 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 SLC29A1Q99808 456 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 INPP5KQ9BT40 448 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 OR51B5Q9H339 312 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 C1GALT1Q9NS00 363 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 TM7SF3Q9NS93 570 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PNPLA3Q9NST1 481 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 UCKL1Q9NWZ5 548 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 ADPRHL2Q9NX46 363 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 KLF15Q9UIH9 416 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 BAG5Q9UL15 447 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PSME2Q9UL46 239 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 WDR37Q9Y2I8 494 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 TRPM6Q9BX84 2022 aa10.15□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 LRP4O75096 1905 aa10.15□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 POM121BA6NF01 834 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 A8MVJ9 347 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 G3V2T6 193 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 TXNDC9O14530 226 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 OR1F1O43749 312 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SDC3O75056 442 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PRKD3O94806 890 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 KLHL18O94889 574 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SOX30O94993 753 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 LRATO95237 230 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 H6PDO95479 791 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CST1P01037 141 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 FTH1P19P0C7X4 201 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 F3P13726 295 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ITGA2P17301 1181 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CKMT2P17540 419 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SDHBP21912 280 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CDKN2CP42773 168 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MAPK12P53778 367 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SRP54P61011 504 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SELENOWP63302 87 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SLC9A5Q14940 896 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 HKDC1Q2TB90 917 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF542PQ5EBM4 170 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CRB2Q5IJ48 1285 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 FAM219BQ5XKK7 198 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF425Q6IV72 752 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 IQCHQ86VS3 1027 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CARM1Q86X55 608 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CBR4Q8N4T8 237 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MFSD9Q8NBP5 474 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 OR2L3Q8NG85 312 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CEP76Q8TAP6 659 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 LZICQ8WZA0 190 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF347Q96SE7 839 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SEPHS2Q99611 448 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 EBPLQ9BY08 206 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 NLNQ9BYT8 704 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 CHST8Q9H2A9 424 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 NTN4Q9HB63 628 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 MIEF1Q9NQG6 463 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 POT1Q9NUX5 634 aa10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.13□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa10.13□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 A6NCN8 305 aa10.13□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 TRIM64A6NGJ6 449 aa10.13□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PDZK1P1A8MUH7 402 aa10.13□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 UPK1AO00322 258 aa10.13□□□□□ -0.79
CDCA3-201ENST00000229265 PLPP1O14494 284 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms