RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam109bQ14B98 259 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CfiQ61129 603 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ugt2b35Q8BJL9 529 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eme1Q8BJW7 570 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf410Q8BKX7 478 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Palm2Q8BR92 376 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 IlvblQ8BU33 632 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RhdQ8CF94 418 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mill2Q8HWE5 355 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr541Q8VGM0 312 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Oosp1Q925U0 202 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Riok2Q9CQS5 547 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Yif1bQ9CX30 311 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Twist2Q9D030 160 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hhipl2Q9D2G9 717 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adad2Q9D5P4 478 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Erp27Q9D8U3 272 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fbxl12Q9EPX5 326 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrpl46Q9EQI8 283 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Thap11Q9JJD0 305 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv6-29A0A0G2JEI6 115 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BC024063A0A1W2P7G7 749 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cytl1A1E5L0 139 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ndor1A2AI05 598 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm44G3UW88 330 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mpzl2O70255 215 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rb1P13405 921 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abcb1aP21447 1276 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnj2P35561 428 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Guca1aP43081 202 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nrg2P56974 756 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb23Q30KP0 166 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cnpy1Q4VAB4 94 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pabpc2Q62029 628 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdk6Q64261 326 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zswim9Q6DI92 447 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q6P2K3 674 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olig3Q6PFG8 273 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Derl2Q8BNI4 239 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Peli2Q8BST6 419 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pithd1Q8BWR2 211 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Samd7Q8C8Y5 445 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smco1Q8CEZ1 214 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1700020N01RikQ8CF20 87 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ugt2b34Q8K154 532 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Polr1eQ8K202 482 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nusap1Q9ERH4 427 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cpne6Q9Z140 557 aa17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam136b-psA0A140T8T1 138 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5938A2AEN9 163 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HgdO09173 445 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AmbnO55189 407 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phkg1P07934 388 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nat3P50296 290 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 OcmP51879 109 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pou1f1Q00286 291 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp39Q02525 718 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 InhaQ04997 366 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam46cQ5SSF7 391 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnh1Q60603 989 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp11bQ6DFW5 1175 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FukQ7TMC8 1090 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr855Q7TRF8 312 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hamp2Q80T19 83 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf786Q8BV42 777 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sall4Q8BX22 1067 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ScgnQ91WD9 276 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Use1Q9CQ56 270 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ephx1Q9D379 455 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc81Q9D5W4 654 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Armc8Q9DBR3 673 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trpv4Q9EPK8 871 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AnkhQ9JHZ2 492 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clca3a1Q9QX15 902 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tdrd6P61407 2134 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp383A0A087WRR7 490 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam209A2APA5 170 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EXOC1LB9EK06 172 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kctd17E0CYQ0 296 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10608E9PZ13 166 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm7714E9Q079 131 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r56E9Q4U5 779 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp2d37-psF6YKB5 150 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17019K7N6W5 255 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8926L7MUE8 181 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RngttO55236 597 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2-AaP01910 256 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 S100a9P31725 113 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rad51Q08297 339 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr629Q0VBH3 314 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fstl1Q62356 306 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zmiz1Q6P1E1 1072 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mfn1Q811U4 741 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmsb15lQ8C0W0 80 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FbrsQ8R089 466 aa17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Map3k21Q8VDG6 1002 aa17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.4 ms