RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS42Q7Z5A4 293 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CLECL1Q8IZS7 167 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM47BQ8NA70 645 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8J3Q8NGG0 315 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 STARD5Q9NSY2 213 aa23.6■■□□□ 1.37
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PR48 441 aa23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC41A2Q96JW4 573 aa23.58■■□□□ 1.36
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CAPNS1-215ENST00000628018 SH3GL1Q99961 368 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 IKZF5Q9H5V7 419 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 C5AR2Q9P296 337 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 PDP2Q9P2J9 529 aa23.56■■□□□ 1.36
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