RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	CERS1	P27544	350 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	NEK2	P51955	445 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	LIM2	P55344	173 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	BIK	Q13323	160 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	LY6D	Q14210	128 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	IMPG1	Q17R60	797 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SYT16	Q17RD7	645 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM205	Q6UW68	189 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	METTL4	Q8N3J2	472 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC39A7	Q92504	469 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SH3GL2	Q99962	352 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	MECR	Q9BV79	373 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A1B0GTL3	188 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SOCS6	O14544	535 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	PRMT3	O60678	531 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	UQCRH	P07919	91 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	FGF4	P08620	206 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	FURIN	P09958	794 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	OLR1	P78380	273 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SGO1	Q5FBB7	561 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ING2	Q9H160	280 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	LANCL2	Q9NS86	450 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A0A6YYD5	115 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A0G2JN53	185 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC28A1	O00337	649 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	RGS14	O43566	566 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	HSPA4L	O95757	839 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	CPN2	P22792	545 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	BSG	P35613	385 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SOX8	P57073	446 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	RHAG	Q02094	409 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SLAMF1	Q13291	335 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	RUNX2	Q13950	521 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SERTAD2	Q14140	314 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	TERF2	Q15554	542 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	NSDHL	Q15738	373 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	KANK2	Q63ZY3	851 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ATG16L1	Q676U5	607 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	GPR180	Q86V85	440 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	TANK	Q92844	425 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-215	ENST00000596522	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms