RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TBCCQ15814 346 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ACER2Q5QJU3 275 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CHSY3Q70JA7 882 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 BEST3Q8N1M1 668 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 FAM47BQ8NA70 645 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 FAR1Q8WVX9 515 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PHF21BQ96EK2 531 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 WDR34Q96EX3 536 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SERINC2Q96SA4 455 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CENPKQ9BS16 269 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MMP25Q9NPA2 562 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 COPG2Q9UBF2 871 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SPACA6W5XKT8 324 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ESPL1Q14674 2120 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SCN2AQ99250 2005 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 BLACEA4D250 179 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 EBAG9O00559 213 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PRAMEF2O60811 474 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM24O75264 130 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MYO1DO94832 1006 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MTHFD2P13995 350 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 EPORP19235 508 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TNNI3P19429 210 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CD22P20273 847 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CNTFP26441 200 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CERS1P27544 350 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PIK3CGP48736 1102 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RAP1GDS1P52306 607 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RAB38P57729 211 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 STX4Q12846 297 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2H2Q13888 395 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SETDB1Q15047 1291 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 GRHL2Q6ISB3 625 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 BCORP1Q8N888 145 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 OR7G3Q8NG95 312 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 REPS1Q96D71 796 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 KCNC2Q96PR1 638 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 AICDAQ9GZX7 198 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 OR51B5Q9H339 312 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 IPPKQ9H8X2 491 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL1Q9NR64 748 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 OLAHQ9NV23 265 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF358Q9NW07 568 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 GABRR3A8MPY1 467 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA7AO75326 666 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms