RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 CROTQ9UKG9 612 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPTBP11277 2137 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A1W2PR48 441 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 HYKKA2RU49 373 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 C4orf47A7E2U8 309 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM150CB9EJG8 249 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 FXYD1O00168 92 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 CBFA2T3O75081 653 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PGM1P36871 562 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPR19Q15760 415 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF385BQ569K4 471 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 DLEU7Q6UYE1 221 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERHLQ9NQF3 203 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 D6RAR5 112 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PROM1O43490 865 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBX19O60806 448 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR2B3O76000 313 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ALDH9A1P49189 494 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 EMP3P54852 163 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 CORO7P57737 925 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PSME3P61289 254 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLIN5Q00G26 463 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 RUNX2Q13950 521 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM53BQ14153 422 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPIDRQ14159 915 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRM7Q14831 915 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKRD46Q86W74 232 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLITRK4Q8IW52 837 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 RCBTB1Q8NDN9 531 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 VPS37AQ8NEZ2 397 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ITCHQ96J02 903 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC74BQ96LY2 380 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 C10orf90Q96M02 699 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC39A3Q9BRY0 314 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKHQ9HCJ1 492 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 DAPP1Q9UN19 280 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 CROCCQ5TZA2 2017 aa22.14■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNH1O95259 989 aa22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANXA8L1Q5VT79 327 aa22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 DHDDSQ86SQ9 333 aa22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNAJB8Q8NHS0 232 aa22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 FGF21Q9NSA1 209 aa22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 EHD3Q9NZN3 535 aa22.14■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 C1orf226A1L170 272 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNAJB6O75190 326 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 MED26O95402 600 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 LIM2P55344 173 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOXM1Q08050 763 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 MPEG1Q2M385 716 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 C18orf63Q68DL7 685 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 NIPAL1Q6NVV3 410 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR1L3Q8NH93 324 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDRT15Q96T59 188 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 LYRM4Q9HD34 91 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHF11Q9UIL8 331 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERTAD3Q9UJW9 196 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.13■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 AIFM1O95831 613 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDX5P17844 614 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 MUM1Q2TAK8 710 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM47BQ8NA70 645 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR9A4Q8NGU2 314 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 UCN3Q969E3 161 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 MIEF2Q96C03 454 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 FANCEQ9HB96 536 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 SGK494L7N484 410 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 RFXANKO14593 260 aa22.12■■□□□ 1.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOXS1O43638 330 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms