RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576380.5

P4HB-222, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 3

Gene P4HB, Length 943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-222	ENST00000576380	CTNS	O60931	367 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	SH3BGRL	O75368	114 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	SBK3	P0C264	359 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	PIK3CG	P48736	1102 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	RCN2	Q14257	317 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	NR6A1	Q15406	480 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	MTBP	Q96DY7	904 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	LYRM4	Q9HD34	91 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	XPR1	Q9UBH6	696 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	FETUB	Q9UGM5	382 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	OR7A17	O14581	309 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	MAN1A2	O60476	641 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	SMIM24	O75264	130 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	SCEL	O95171	688 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	CLDN9	O95484	217 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	MYBL2	P10244	700 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	SLC13A2	Q13183	592 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	FHL5	Q5TD97	284 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	BEST3	Q8N1M1	668 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	SLC5A8	Q8N695	610 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	FAM47B	Q8NA70	645 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	RGMA	Q96B86	450 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	CSF3R	Q99062	836 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	NTMT1	Q9BV86	223 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	FLNC	Q14315	2725 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.62
P4HB-222	ENST00000576380	CD96	P40200	585 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	GPR143	P51810	404 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	ARFIP1	P53367	373 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	TAS2R50	P59544	299 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	LGI4	Q8N135	537 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	PRR7	Q8TB68	274 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	REPS1	Q96D71	796 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	TAAR6	Q96RI8	345 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	PCTP	Q9UKL6	214 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	POLE	Q07864	2286 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	CDK2AP1	O14519	115 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	PRAMEF2	O60811	474 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	NEK2	P51955	445 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	SLAMF1	Q13291	335 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	TUBA3C	Q13748	450 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	TERF2	Q15554	542 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	CDK15	Q96Q40	435 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	ABI3	Q9P2A4	366 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	PLPP1	O14494	284 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	MYO1D	O94832	1006 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	PPP2R1B	P30154	601 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	SSR2	P43308	183 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	CCNG1	P51959	295 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	CUL3	Q13618	768 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	INA	Q16352	499 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-222	ENST00000576380	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		18.87	■□□□□ 0.61

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