RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF10	O60809	474 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL18	O94889	574 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	STS	P08842	583 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	ADORA3	P0DMS8	318 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	CBL	P22681	906 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	IRF3	Q14653	427 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	17.59	■□□□□ 0.41
RRN3-205	ENST00000563559	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PCDH17	O14917	1159 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM23	O75077	832 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	UPK1B	O75841	260 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	S100A5	P33763	92 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT6	P53370	316 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	DPT	Q07507	201 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	LCTL	Q6UWM7	567 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	TAGAP	Q8N103	731 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	OR2L2	Q8NH16	312 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		17.58	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	VEGFD	O43915	354 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA3D	O95025	777 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CSF2RA	P15509	400 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB7	P26010	798 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ACADL	P28330	430 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	TGFBR1	P36897	503 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	RGS6	P49758	472 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF45	Q02386	682 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CDC20	Q12834	499 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	DNASE1L3	Q13609	305 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PDXP	Q96GD0	296 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CLN6	Q9NWW5	311 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	KCND3	Q9UK17	655 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf58	C9J3I9	102 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559		J3KTA2	159 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CISD3	P0C7P0	127 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	KEL	P23276	732 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH9A1	P49189	494 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	DHCR24	Q15392	516 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	COLEC12	Q5KU26	742 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	IER5L	Q5T953	404 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CADM3	Q8N126	398 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF366	Q8N895	744 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	TMIE	Q8NEW7	156 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		17.57	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ZAR1L	A6NP61	321 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	TLL1	O43897	1013 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	TBX19	O60806	448 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	DDC	P20711	480 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CRISP1	P54107	249 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PRKCD	Q05655	676 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	NEURL3	Q96EH8	262 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	IFT52	Q9Y366	437 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559		K7ESM1	405 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SPINT1	O43278	529 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PDE9A	O76083	593 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PAPLN	O95428	1278 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	TIMP1	P01033	207 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PTH	P01270	115 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00271	P0C7V0	271 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	POU2F1	P14859	743 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CXCR2	P25025	360 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINB1	P30740	379 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ERVFC1	P60507	584 aa		17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	17.56	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	RPA4	Q13156	261 aa		17.56	■□□□□ 0.4

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