RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 KCNK13Q9HB14 408 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 VPS4AQ9UN37 437 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 ESPL1Q14674 2120 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 A0A1B0GTL3 188 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 DYTNA2CJ06 578 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 H0YIV9 168 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 UGDHO60701 494 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 ETHE1O95571 254 aa19.54■□□□□ 0.72
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CS-222ENST00000550996 PIK3CBP42338 1070 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 RPS13P62277 151 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 TGM3Q08188 693 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 TRAF3Q13114 568 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 ACER2Q5QJU3 275 aa19.54■□□□□ 0.72
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CS-222ENST00000550996 BEST3Q8N1M1 668 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 WDR20Q8TBZ3 569 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 MTBPQ96DY7 904 aa19.54■□□□□ 0.72
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CS-222ENST00000550996 TBCDQ9BTW9 1192 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
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CS-222ENST00000550996 FETUBQ9UGM5 382 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 A8MT66 165 aa19.53■□□□□ 0.72
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CS-222ENST00000550996 PLPP1O14494 284 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 SMIM24O75264 130 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 TNFRSF8P28908 595 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 NEK2P51955 445 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 HSD17B7P56937 341 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 NR6A1Q15406 480 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
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CS-222ENST00000550996 ZNF595Q8IYB9 648 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 GRHL3Q8TE85 626 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 LYRM4Q9HD34 91 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 TMCO1Q9UM00 188 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 TRAV17A0A0B4J275 112 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 OR5H15A6NDH6 313 aa19.52■□□□□ 0.72
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CS-222ENST00000550996 CBX6O95503 412 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 SSR2P43308 183 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 SLC13A2Q13183 592 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 CHSY3Q70JA7 882 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 APCDD1LQ8NCL9 501 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
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CS-222ENST00000550996 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 ZNF354BQ96LW1 612 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 TAAR6Q96RI8 345 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 TBK1Q9UHD2 729 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 ADGRE2Q9UHX3 823 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 MYO1DO94832 1006 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 CLDN9O95484 217 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 TSPAN8P19075 237 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 TUBA3CQ13748 450 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 AP5B1Q2VPB7 878 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 OR4C11Q6IEV9 310 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 TUBA3EQ6PEY2 450 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 NTMT1Q9BV86 223 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 ROGDIQ9GZN7 287 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 PRM3Q9NNZ6 103 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 TEKT2Q9UIF3 430 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 SVILO95425 2214 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PPM1 405 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 CLDN4O14493 209 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 CTNSO60931 367 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 EEDO75530 441 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 PYGBP11216 843 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 GPR143P51810 404 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-222ENST00000550996 CCNG1P51959 295 aa19.5■□□□□ 0.71
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