RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 CHEK1O14757 476 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HAT1O14929 419 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 STX7O15400 261 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 UPK3AO75631 287 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 H6PDO95479 791 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ANP32DO95626 131 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NFATC1O95644 943 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CPNE6O95741 557 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 BAG3O95817 575 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD34CP0C6C1 535 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 IL32P24001 234 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ACKR3P25106 362 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PRDX2P32119 198 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC8A1P32418 973 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC9A3P48764 834 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC26A2P50443 739 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NDST1P52848 882 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MTCP1P56278 107 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 P2RX3P56373 397 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SEC61GP60059 68 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 S100A12P80511 92 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CDK3Q00526 305 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 COL10A1Q03692 680 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FOXM1Q08050 763 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SREBF2Q12772 1141 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HYAL1Q12794 435 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NME3Q13232 169 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HEPACAMQ14CZ8 416 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIP10Q15642 601 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 UGT3A2Q3SY77 523 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DCAF6Q58WW2 860 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 EPHA10Q5JZY3 1008 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LGSNQ5TDP6 509 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ASPHD2Q6ICH7 369 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LCTLQ6UWM7 567 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM107Q6UX40 140 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP4Z1Q86W10 505 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 AMIGO1Q86WK6 493 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 VSTM4Q8IW00 320 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 STHQ8IWL8 128 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC8AQ8IWT6 810 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF276Q8N554 614 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PQLC3Q8N755 202 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SYT14Q8NB59 555 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM104Q8NE00 496 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ENGASEQ8NFI3 743 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OR8J2Q8NGG1 315 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC44A1Q8WWI5 657 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GGHQ92820 318 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SEMA4DQ92854 862 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OSTF1Q92882 214 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CERS2Q96G23 380 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLITRK1Q96PX8 696 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RASL10BQ96S79 203 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DDOQ99489 341 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OMDQ99983 421 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TRMOQ9BU70 441 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 WWTR1Q9GZV5 400 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF302Q9NR11 478 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 EURLQ9NYK6 297 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms