RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 TRPV3Q8NET8 790 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 OR5T3Q8NGG3 340 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 NT5CQ8TCD5 201 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 CRB3Q9BUF7 120 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 WDR54Q9H977 334 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 FETUBQ9UGM5 382 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 C3orf18Q9UK00 162 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 SLC22A7Q9Y694 548 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CCDC189A1A4V9 331 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 H0YIG0 161 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SOCS6O14544 535 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 DIAPH2O60879 1101 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SMIM24O75264 130 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SH3BGRLO75368 114 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 BMP10O95393 424 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CBX6O95503 412 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 HEXBP07686 556 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SERPINA6P08185 405 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SBK3P0C264 359 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PCNAP12004 261 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ALOX12P18054 663 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 KRT15P19012 456 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MMP11P24347 488 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 BTN3A2P78410 334 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RAPSNQ13702 412 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GTF2H2Q13888 395 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 HERC3Q15034 1050 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.969e-14■■■□□ 15.6
CS-217ENST00000550044 TLR1Q15399 786 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RBBP7Q16576 425 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SLC6A19Q695T7 634 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 WDR93Q6P2C0 686 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 KIRREL2Q6UWL6 708 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MED25Q71SY5 747 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 AMER2Q8N7J2 671 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MZB1Q8WU39 189 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 C8orf44Q96CB5 159 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 WDR34Q96EX3 536 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PEX11GQ96HA9 241 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 AICDAQ9GZX7 198 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 EHD1Q9H4M9 534 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NT5DC2Q9H857 520 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 IPPKQ9H8X2 491 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SCN3AQ9NY46 2000 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PCSK5Q92824 1860 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 LRIT2A6NDA9 550 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 URADA6NGE7 173 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 IDSB3KWA1 339 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 C4orf51C9J302 202 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 AGPSO00116 658 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 E2F3O00716 465 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PAX4O43316 350 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CHST10O43529 356 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 DPM1O60762 260 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TGFB1P01137 390 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 IGHEP01854 428 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TSPAN8P19075 237 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CASP2P42575 452 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 XCR1P46094 333 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PIK3CGP48736 1102 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 EFNA3P52797 238 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PLA2G16P53816 162 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RRADP55042 308 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 LAPTM5Q13571 262 aa9.07□□□□□ -0.96
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