RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541615.5

SNHG1-218, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNHG1, Length 748 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-218ENST00000541615 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 TSPAN19P0C672 248 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 UCHL3P15374 230 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 CHRNB2P17787 502 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 PFKLP17858 780 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 LBPP18428 481 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 NR2F2P24468 414 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 KLRC2P26717 231 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 BDKRB2P30411 391 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SFNP31947 248 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 AHRP35869 848 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 MMP12P39900 470 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SLC1A2P43004 574 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 MAGEB1P43366 347 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 MAP2K3P46734 347 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SLC11A2P49281 568 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 ZNF81P51508 661 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 CCR5P51681 352 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 GTF2A2P52657 109 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 CDH11P55287 796 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 MC2RQ01718 297 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 FOXM1Q08050 763 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 PPP3CAQ08209 521 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 TFCP2Q12800 502 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 TROAPQ12815 778 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 POU4F2Q12837 409 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 DUSP8Q13202 625 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 DAG1Q14118 895 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 PRPSAP1Q14558 356 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 GRIN2CQ14957 1233 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 MPPED2Q15777 294 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 ECM1Q16610 540 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 ERFEQ4G0M1 354 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SBK1Q52WX2 424 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 COQ5Q5HYK3 327 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 C10orf120Q5SQS8 335 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 LRIF1Q5T3J3 769 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SULT6B1Q6IMI4 303 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 LCN8Q6JVE9 175 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 TMEM107Q6UX40 140 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 DLK2Q6UY11 383 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SV2BQ7L1I2 683 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 LDHDQ86WU2 507 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 KLBQ86Z14 1044 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 VRK3Q8IV63 474 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 NIM1KQ8IY84 436 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 KATNAL2Q8IYT4 538 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 NLGN4XQ8N0W4 816 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 CERS5Q8N5B7 392 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 ZNF383Q8NA42 475 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 OR4C15Q8NGM1 316 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 STK35Q8TDR2 534 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 GRHL3Q8TE85 626 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 BTN2A2Q8WVV5 523 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 ASB13Q8WXK3 278 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 ALG3Q92685 438 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SLCO4A1Q96BD0 722 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 MYO19Q96H55 970 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 CRELD1Q96HD1 420 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 MEGF10Q96KG7 1140 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 MUS81Q96NY9 551 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 OR2M2Q96R28 347 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 TEAD3Q99594 435 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SPXQ9BT56 116 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 APOL6Q9BWW8 343 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SEMA4CQ9C0C4 833 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 COMMD4Q9H0A8 199 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 ENKD1Q9H0I2 346 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 LRRN3Q9H3W5 708 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 DUSP21Q9H596 190 aa4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNHG1-218ENST00000541615 SIRT7Q9NRC8 400 aa4.99□□□□□ -1.61
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