RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524087.5

NPIPB11-201, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 3,653 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-201ENST00000524087 ASIC5Q9NY37 505 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 MAP10Q9P2G4 905 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 BSNQ9UPA5 3926 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CEP250Q9BV73 2442 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ETHE1O95571 254 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 RPN2P04844 631 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CEACAM1P13688 526 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 SDC1P18827 310 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 KELP23276 732 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 SLC6A2P23975 617 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 HPCAL1P37235 193 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CDKN2CP42773 168 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 SOX8P57073 446 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 EMX2Q04743 252 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 Q6ZSR6 202 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 USP53Q70EK8 1073 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 PDZD3Q86UT5 571 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 THAP11Q96EK4 314 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 RHCGQ9UBD6 479 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.13□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 NCOR2Q9Y618 2525 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 PIPSLA2A3N6 862 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 OR6C74A6NCV1 312 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 KMOO15229 486 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CST1P01037 141 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 IL3P08700 152 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CD38P28907 300 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 SLC9A5Q14940 896 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.273e-10■■■■■ 64.9
NPIPB11-201ENST00000524087 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 LMX1AQ8TE12 382 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 DDA1Q9BW61 102 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CHID1Q9BWS9 393 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ABCG4Q9H172 646 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 SPAG17Q6Q759 2223 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 A0A1W2PPV9 198 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 EI24O14681 340 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 NUDT7P0C024 238 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 MAGP20916 626 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ALAS2P22557 587 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 HRH2P25021 359 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 GALNSP34059 522 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 FNTBP49356 437 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CDH15P55291 814 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 PIGGQ5H8A4 983 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 FGD3Q5JSP0 725 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ENPP6Q6UWR7 440 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 OOSP2Q86WS3 158 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 OR56A3Q8NH54 315 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 NT5CQ8TCD5 201 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 DNAJA3Q96EY1 480 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ITCHQ96J02 903 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 OR4K3Q96R72 315 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 SPTA1P02549 2419 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 PRSS38A1L453 326 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CLIC1O00299 241 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ANXA6P08133 673 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 CDH3P22223 829 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 NR4A1P22736 598 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 PKLRP30613 574 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 HNMTP50135 292 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 BTN3A2P78410 334 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 TAP2Q03519 686 aa7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 GANABQ14697 944 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NPIPB11-201ENST00000524087 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms