RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516539.1

RNU6-1256P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1256, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1256P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BPIFA2Q96DR5 249 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IGSF21Q96ID5 467 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IL12RB2Q99665 862 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FUNDC2Q9BWH2 189 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SHARPINQ9H0F6 387 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 COG4Q9H9E3 785 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CD93Q9NPY3 652 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ERVK-18Q9QC07 812 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ATXN10Q9UBB4 475 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PILRAQ9UKJ1 303 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SNX6Q9UNH7 406 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RNF123Q5XPI4 1314 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TCP10L2B9ZVM9 353 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC1A7O00341 560 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MAGEB3O15480 346 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RIPK2O43353 540 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BUB1O43683 1085 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EXTL3O43909 919 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TBX19O60806 448 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CSO75390 466 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EDN1P05305 212 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EPB41P11171 864 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 B4GALT1P15291 398 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EZRP15311 586 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TMOD1P28289 359 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GJB2P29033 226 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PRDX2P32119 198 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OTX2P32243 289 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DSCR9P59020 149 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SQLEQ14534 574 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OR1C1Q15619 314 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC36A3Q495N2 470 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ACCSLQ4AC99 568 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CEP55Q53EZ4 464 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 AGKQ53H12 422 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 XKR3Q5GH77 459 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TECRLQ5HYJ1 363 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ARHGEF16Q5VV41 709 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 C9orf57Q5W0N0 161 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ARHGAP17Q68EM7 881 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RTL6Q6ICC9 239 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OR4C11Q6IEV9 310 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LEKR1Q6ZMV7 388 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BNIPLQ7Z465 357 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PIGZQ86VD9 579 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC22A16Q86VW1 577 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BANPQ8N9N5 519 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DMBX1Q8NFW5 382 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OR1L3Q8NH93 324 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OLIG1Q8TAK6 271 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GOLGA5Q8TBA6 731 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNRF4Q8WWF5 429 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PHYHIPQ92561 330 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC35C1Q96A29 364 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CCDC51Q96ER9 411 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MARK4Q96L34 752 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PSD2Q9BQI7 771 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ERP44Q9BS26 406 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EGLN1Q9GZT9 426 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 WWP1Q9H0M0 922 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 THAP2Q9H0W7 228 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC26A1Q9H2B4 701 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EGLN3Q9H6Z9 239 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF665Q9H7R5 613 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HACD3Q9P035 362 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HPCAL4Q9UM19 191 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CHMP2BQ9UQN3 213 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 A0A087WZ39 114 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 A0A1B0GUL7 405 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MTMR11A4FU01 709 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LACTBL1A8MY62 500 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PDXKO00764 312 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LANCL1O43813 399 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SAP30O75446 220 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SPAG6O75602 509 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms