RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PARD3Q8TEW0 1356 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ABCD4O14678 606 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RIPK2O43353 540 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SNX3O60493 162 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SBK2P0C263 348 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MPZP25189 248 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 XCR1P46094 333 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EVCP57679 992 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GSTO1P78417 241 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMF1P82094 1093 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CXCL9Q07325 125 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RBBP4Q09028 425 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC10A1Q14973 349 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF674Q2M3X9 581 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MFSD12Q6NUT3 480 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NCEH1Q6PIU2 408 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MACC1Q6ZN28 852 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARMC8Q8IUR7 673 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TEX11Q8IYF3 940 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C6orf223Q8N319 242 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TEX26Q8N6G2 289 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BBS1Q8NFJ9 593 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SVIPQ8NHG7 77 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLAMF9Q96A28 289 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HVCN1Q96D96 273 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MS4A10Q96PG2 267 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SH3GLB2Q9NR46 395 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CLIC5Q9NZA1 410 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DPM3Q9P2X0 92 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RLFQ13129 1914 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FSD2A1L4K1 749 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CD59P13987 128 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IL2RGP31785 369 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAPK12P53778 367 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GGTLC2Q14390 218 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GRB14Q14449 540 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CEP57Q86XR8 500 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR65Q8IYL9 337 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IL17REQ8NFR9 667 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MYDGFQ969H8 173 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPDL1Q96EA4 605 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCDHB18PQ96TA0 734 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPNS1Q9H2V7 528 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EXOC1Q9NV70 894 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDP2Q9P2J9 529 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SCML2Q9UQR0 700 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SESN1Q9Y6P5 492 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SHANK1Q9Y566 2161 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A096LNJ9 63 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRRC72A6NJI9 287 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF724A8MTY0 619 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 B4DLN1 442 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AP3D1O14617 1153 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MITFO75030 526 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZWINTO95229 277 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MMP1P03956 469 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 P0C880 135 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC166P0CW27 439 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HSD17B1P14061 328 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPP2R1BP30154 601 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SFTPDP35247 375 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TFPI2P48307 235 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CACNG7P62955 275 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MADCAM1Q13477 382 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SERTAD2Q14140 314 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPTX1Q15818 432 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRSS8Q16651 343 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SBK1Q52WX2 424 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNLZQ5SXM8 178 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NEPROQ6NW34 567 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TEX38Q6PEX7 206 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CLEC1AQ8NC01 280 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 VPS37AQ8NEZ2 397 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LIPHQ8WWY8 451 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SMARCD2Q92925 531 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC25A38Q96DW6 304 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSNARE1Q96NA8 513 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TTYH2Q9BSA4 534 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR51J1Q9H342 316 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF121Q9H920 327 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MLXQ9UH92 298 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCM1Q15154 2024 aa-0.28□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms