RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509638.5

LIMCH1-211, Transcript of LIM and calponin homology domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMCH1, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMCH1-211ENST00000509638 URB1O60287 2271 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 SLCO1B7G3V0H7 640 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 PCDH7O60245 1069 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 JRKO75564 520 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 ZGLP1P0C6A0 271 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 RAB38P57729 211 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 RPL38P63173 70 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 EFCAB3Q8N7B9 438 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM47BQ8NA70 645 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 TBC1D20Q96BZ9 403 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 MIEF2Q96C03 454 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 TUBGCP3Q96CW5 907 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 OR1F2PQ96R84 312 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 GPR87Q9BY21 358 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 KCND3Q9UK17 655 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 FBXW2Q9UKT8 454 aa27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
LIMCH1-211ENST00000509638 VSTM2BA6NLU5 285 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 SEC22BO75396 215 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 BMP10O95393 424 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 PTPN4P29074 926 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 HK2P52789 917 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 MAPK12P53778 367 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 RAE1P78406 368 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 MAVSQ7Z434 540 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 PROSER1Q86XN7 944 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 TMEM151BQ8IW70 566 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 PPP3R2Q96LZ3 170 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 CSF3RQ99062 836 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 TGIF2Q9GZN2 237 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 MEAF6Q9HAF1 191 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 MCM8Q9UJA3 840 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 ZZEF1O43149 2961 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 TMEM8BA6NDV4 472 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 EDF1O60869 148 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 PEX11AO75192 247 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 FHP07954 510 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM58BPP0C7Q3 252 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 GYS2P54840 703 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 GALNT18Q6P9A2 607 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM53CQ9NYF3 392 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 KCMF1Q9P0J7 381 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 PHF11Q9UIL8 331 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 TCFL5Q9UL49 500 aa27.94■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 TRPC5OSA6NMA1 111 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 CD63P08962 238 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 KLC1Q07866 573 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 ERV3-1Q14264 604 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 MINDY4Q4G0A6 757 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 MFSD4BQ5TF39 518 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 GPR180Q86V85 440 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 OR2Y1Q8NGV0 311 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM117AQ9C073 453 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 SIRT5Q9NXA8 310 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 ASB4Q9Y574 426 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 USH1CQ9Y6N9 552 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 SPACA6W5XKT8 324 aa27.93■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM227AF5H4B4 570 aa27.92■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 RRP8O43159 456 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 FOLR3P41439 243 aa27.92■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 KIAA0040Q15053 153 aa27.92■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa27.92■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 SPACA3Q8IXA5 215 aa27.92■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 EFHD1Q9BUP0 239 aa27.92■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 LANCL2Q9NS86 450 aa27.92■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 ATG4BQ9Y4P1 393 aa27.92■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 SDHDO14521 159 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 IL10P22301 178 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 CPN2P22792 545 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 JAK1P23458 1154 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 TNFRSF17Q02223 184 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 NOXRED1Q6NXP6 359 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 LAPTM4BQ86VI4 370 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 STARD8Q92502 1023 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 CRB3Q9BUF7 120 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 MKL2Q9ULH7 1088 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 TMED5Q9Y3A6 229 aa27.91■■■□□ 2.06
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF195O14628 629 aa27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms