RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 TSC22D3Q99576 134 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 C16orf70Q9BSU1 422 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 HGH1Q9BTY7 390 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACP6Q9NPH0 428 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SAR1AQ9NR31 198 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CISHQ9NSE2 258 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PARVAQ9NVD7 372 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 DPP3Q9NY33 737 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANAPC7Q9UJX3 599 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GTF3C4Q9UKN8 822 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIAA1257Q9ULG3 409 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHKBQ9Y259 395 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 VDAC3Q9Y277 283 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q9Y3F1 56 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCN4AP35499 1836 aa3.93□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GOLGA8SH3BPF8 625 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC16A5O15375 505 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GRID2O43424 1007 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 TSPAN1O60635 241 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 EDF1O60869 148 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMIM24O75264 130 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF217O75362 1048 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACSL3O95573 720 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PMS2P2O95744 297 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 LSM8O95777 96 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ASS1P00966 412 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ABHD2P08910 425 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 DAOP14920 347 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GJA1P17302 382 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCNA5P22460 613 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SP100P23497 879 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 NMBRP28336 390 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTPN4P29074 926 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCK1P35558 622 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PEX19P40855 299 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PSMC4P43686 418 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD81P60033 236 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 COG7P83436 770 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 BEX3Q00994 111 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL9RQ01113 521 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLC1Q07866 573 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CALCOCO2Q13137 446 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBE2V1Q13404 147 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SNTA1Q13424 505 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SNX1Q13596 522 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 RASA2Q15283 850 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SYT16Q17RD7 645 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC27A1Q6PCB7 646 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 VSIG1Q86XK7 387 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CEP97Q8IW35 865 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC5A8Q8N695 610 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPATA22Q8NHS9 363 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPP4R1Q8TF05 950 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GRK7Q8WTQ7 553 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 C10orf82Q8WW14 230 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 C1orf54Q8WWF1 131 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIGTQ969N2 578 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SNF8Q96H20 258 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SNX25Q9H3E2 840 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GAREM1Q9H706 876 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MINDY3Q9H8M7 445 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CYP3A43Q9HB55 503 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANAPC5Q9UJX4 755 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 C2CD2Q9Y426 696 aa3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms