RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619		K7EQG2	157 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	MLNR	O43193	412 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRKCI	P41743	596 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC1A6	P48664	564 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	MR1	Q95460	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PFAS	O15067	1338 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	FBP2	O00757	339 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAD51D	O75771	328 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	REN	P00797	406 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PEX3	P56589	373 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619		M0R296	226 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SELENOF	O60613	162 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGHG1	P01857	330 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	MATK	P42679	507 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	IER3	P46695	156 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	GSK3B	P49841	420 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	FOLH1	Q04609	750 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RUNX3	Q13761	415 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SEPT8	Q92599	483 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	VPS18	Q9P253	973 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACSL4	O60488	711 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	LYN	P07948	512 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACKR3	P25106	362 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SRD5A2	P31213	254 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	BACE1	P56817	501 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76

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