RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	PFDN6	O15212	129 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	KMO	O15229	486 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	KCNJ13	O60928	360 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	USP12	O75317	370 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	DCTN3	O75935	186 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	METTL18	O95568	372 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NTN1	O95631	604 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	AP2A1	O95782	977 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TTC4	O95801	387 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SHBG	P04278	402 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	APRT	P07741	180 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ITGA5	P08648	1049 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TPH1	P17752	444 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	IDS	P22304	550 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ADRA1D	P25100	572 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ADRA1A	P35348	466 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MAGEA4	P43358	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	KCNJ1	P48048	391 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	POLD2	P49005	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NPY2R	P49146	381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ACADVL	P49748	655 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PRKAG1	P54619	331 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	WNT3	P56703	355 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TUBA4A	P68366	448 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SHC2	P98077	582 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	IHH	Q14623	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	POU6F1	Q14863	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TMED2	Q15363	201 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	INSC	Q1MX18	579 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293		Q6ZWC4	215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	COX14	Q96I36	57 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CLPB	Q9H078	707 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBM39-240	ENST00000495293	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71

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