RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492778.5

CRAMP1-207, Transcript of cramped chromatin regulator homolog 1, humanhuman

TSL 4

Gene CRAMP1, Length 573 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1-207ENST00000492778 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 RUNX2Q13950 521 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 DOC2AQ14183 400 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 GRTP1Q5TC63 336 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 MROH9Q5TGP6 573 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 RNF175Q8N4F7 328 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 SLC5A8Q8N695 610 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 M1APQ8TC57 530 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 NR4A3Q92570 626 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 F2RL3Q96RI0 385 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 GPR22Q99680 433 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 SARGQ9BW04 601 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 MMP25Q9NPA2 562 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 LRFN1Q9P244 771 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.3□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 SCN3AQ9NY46 2000 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ESPL1Q14674 2120 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 LRIT2A6NDA9 550 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 B3GALT2O43825 422 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 CDH16O75309 829 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TGFB1P01137 390 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 IFNA16P05015 189 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 CD46P15529 392 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TNNI3P19429 210 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 IL10P22301 178 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 STX2P32856 288 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 RFC3P40938 356 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TDGF1P3P51864 188 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ATP6V0D1P61421 351 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 HSF1Q00613 529 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 IRF8Q02556 426 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 CHIT1Q13231 466 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 MPP2Q14168 576 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 PDK4Q16654 411 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TRABD2AQ86V40 505 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 DOK4Q8TEW6 326 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 NXNL1Q96CM4 212 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 CSF3RQ99062 836 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 CENPHQ9H3R5 247 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.29□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 ANKRD12Q6UB98 2062 aa8.28□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 LRRC14BA6NHZ5 514 aa8.28□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.28□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.28□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 CCL21O00585 134 aa8.28□□□□□ -1.08
CRAMP1-207ENST00000492778 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms