RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM221A6NGB7 291 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TLCD2A6NGC4 264 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 M0R296 226 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TNFRSF11BO00300 401 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 BCHEP06276 602 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CD63P08962 238 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TFPIP10646 304 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 SLC19A1P41440 591 aa7.9□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 DCST1Q5T197 706 aa7.9□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.9□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.9□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 U3KQV3 271 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 CERS1P27544 350 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 HSD11B2P80365 405 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 TANKQ92844 425 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 CEP19Q96LK0 163 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 H0YGG7 62 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 SDC1P18827 310 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRD-211ENST00000486161 TRIM23P36406 574 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 ACTR3P61158 418 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRD-211ENST00000486161 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
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