RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 GP2P55259 537 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 MICAQ29983 383 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 C2orf27AQ580R0 203 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 ANKRD54Q6NXT1 300 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 PRSS48Q7RTY5 328 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 NUDT13Q86X67 352 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 ATG16L2Q8NAA4 619 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 NFKBIDQ8NI38 313 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 KCND3Q9UK17 655 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 SAP18O00422 153 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 NTRK1P04629 796 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 IRF4Q15306 451 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 MOGQ16653 247 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 RNF130Q86XS8 419 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 PARP8Q8N3A8 854 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 OR2L8Q8NGY9 312 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 S1PR5Q9H228 398 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 EHD3Q9NZN3 535 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 CD207Q9UJ71 328 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 PLAGL1Q9UM63 463 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GVG6 124 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PPW3 197 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFS2O75306 463 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 DIRAS1O95057 198 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 GABARAPO95166 117 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 CD6P30203 668 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 GGT2P36268 569 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 MAPK12P53778 367 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 FGD3Q5JSP0 725 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 YAF2Q8IY57 180 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 SGCDQ92629 289 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 THAP11Q96EK4 314 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 CXorf36Q9H7Y0 433 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 PDPK1O15530 556 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 RPS21P63220 83 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 REEP3Q6NUK4 255 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 FCGR1BQ92637 280 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 YIPF6Q96EC8 236 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 PIP5K1AQ99755 562 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 OCEL1Q9H607 264 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 NDUFS4O43181 175 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 GBAP04062 536 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 DRD2P14416 443 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 ABATP80404 500 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 ZIC1Q15915 447 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-212ENST00000477970 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 RUBCNLQ9H714 662 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 NECTIN3Q9NQS3 549 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 CLDND1Q9NY35 253 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 PRKAB1Q9Y478 270 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 ENPP4Q9Y6X5 453 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0A6YYD5 115 aa11.62□□□□□ -0.55
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